凌云翼不是要全面反对王崇古，他是要清除积弊，让官厂更好的发展，这份奏疏很长很长，在奏疏的开篇，凌云翼肯定了王崇古的贡献。
万历初元，国势凋敝，天下有危亡之象，文成公仰承圣谟，荷剪河山，兴百工以实仓廪，创官厂而利民生，栉风沐雨，十有又六载，肇基新政大业，厂舍鳞次，学堂弦诵，药局施仁，水厂惠民，皆圣君洪福所庇，亦文成公夙夜匪懈之功也。
仁厚为怀，视匠如亲的人情管理方式，更是‘筚路初创，维系人心之良方，褴褛启业，兴工利民之砥柱。’
而凌云翼认为，出现问题的原因也很简单：
法久则弊生，情滥则纲弛，昔日凝聚启业之良药，今日宿弊沉疴之根由，人情过炽则流弊滋蔓，仁厚过重则纲纪疏驰。
官厂的问题主要为三弊：
冗员如附骨，虚耗公帑，坐蠧蚀柱，虚糜国财之弊一；
法例成具文，纲纪荡然，威令不行，法例空悬之弊二；
奸猾总得计，勤恳蒙尘，是非颠倒，唯利是图之弊三。
这官厂三弊，最终造成了‘越老实越吃亏，不占公家便宜就是亏’的共识，这种共识蔓延下去，并且不加改正，必然导致：
匠众离心，利权旁落，朝廷之臂指渐失，巨万之公帑虚掷；仍以温情脉脉之旧规，驭星火燎原之新局，犹抱薪救火，养痈成患。
而面对这三弊，凌云翼和周良寅提出了三破三立：破人情，立规章；破食利，立精效；破朋党，立公体；
三破三立的具体做法为：严考成，汰冗滥；明赏罚，肃纲纪；核成本，杜奢靡；兴学堂，传技艺；调吏员，避亲眷；反贪腐，绝贪渎。
三破三立洋洋洒洒数千言，对每一条进行了详细的陈述，符合皇帝要求的‘现象、问题、原因、方案、复核’的信实分析法，并且给出了具体的‘何时、何地、何因、何事、何人、何做’的六何法。
什么时候、什么地方，因为什么、具体哪件事、由谁去做、会怎么做，这六何是考成法后，群臣上疏谈到具体某件事要怎么改进时，必须要具备的六个元素。
如果连这六个基本元素都不具备，那这篇奏疏，就是缺乏恭顺之心，糊弄陛下。
这考科举，要写八股文，这考完了科举，都成了官选官的统治阶级，还要写官八股！张居正简直是坏事做尽！
但张居正也无可奈何，只能走这种形式主义，因为他在官场这么多年，他知道好多官员上的奏疏，他们自己都没看过。
这非常普遍，奏疏是笔杆子写的，斧正校对是师爷做的，这当官的，连看都不用看。
主官不看，笔杆子和师爷就开始敷衍了事，在万历初年，有些奏疏，一篇不到二百字的短文，就有五六个错别字，三四个语句不通顺的地方。
信实分析法和六何法，这种官八股，就是逼官员把上奏的奏疏看一下。
何人、何时，代表着朝廷可以随时对奏疏呈奏之事进行复查，一旦发现没做，那朝廷会追责，如此之下，官员自然要对每一篇奏疏都仔细看一遍。
凌云翼、周良寅的《官厂厘革积弊疏》从凌云翼回京后就开始草拟，一直到六月初，才完成了初稿，每一件事都有具体的人去负责。
“准行。”朱翊钧稍微犹豫了下，最终朱批了凌云翼的第二本奏疏，在皇帝看来，凌云翼这本奏疏，唯一有些问题的地方，就是他也在搞恩情叙事。
朱翊钧不反对恩情叙事，封建帝制之下，朱翊钧作为皇帝，除非他下退位诏书，宣布大明亡了，否则这恩情叙事就是必然，这太愚蠢了。
但他也认为过犹不及，凌云翼就做的就有些过分了，比如悬旗挂帜彰圣德，比如圣训每日诵读。
做的过头了，容易引起人的逆反心理，朱翊钧将其中比较过分的恩情叙事，删减了一部分，这篇奏疏立刻变得完美了起来。
万历十八年六月，泰西大帆船晚了足足半个月的时间，才抵达了松江府新港停靠，而这一次，大帆船的规模只有三艘，这三艘货船是十八年来最少的一次，连万历元年，都有五条大帆船。
松江市舶司自然要询问原因，如果费利佩不想跟大明做生意了，大帆船也不要来了，经过反复沟通后，才知道为何出现了这样的问题。
本来从利马港出发的大帆船有五艘，可其中两艘迷航在了大洋之中。
费利佩缺少足够的领航员，启用了一批经验不足的领航员，直接导致了船只的迷航，这也是远征失利带来的影响。
经验丰富的水手死在了远征的途中，大西洋的狂暴风暴，吞没了船只和那些水手。
除了迷航之外，富饶银矿再次发生了土著暴动。
富饶银矿的白银产量大幅度下降，本来年产六百五十万两到八百万两白银的富饶银矿，今年只有二百五十万银，导致大帆船没有足够的白银，换取大明货物。
而且智利硝石矿也被波及，产量减少，让西班牙使者颇为焦虑。
可是松江府计算了今年流入大明的白银，相比较去年，富饶银矿流入大明的白银，非但没有减少，反而增多了，从二百万银，增加到了近四百万银的规模。
大明是可以确定白银来源的，缇骑查案里有一条重要的手段就是稽查银路，白银是一种矿产，各地产的白银，有十分细微的差别。
富饶银矿真的发生土著暴动了吗？可是，秘鲁总督府来的船只，依旧带足了白银。
秘鲁总督府正在变得不忠诚，有了自己的小心思，才有了所谓的土著暴动白银减产。
白银压根没有减产，这些白银都到了大明，换取了足够多的货物，洗一遍澡，就成了来源不明、但是很好用的商品。
至于商品的来源？当然是大明走私商人走私过来的！
这次虚无土著暴乱，也造成了智利硝石的减产。
智利硝石去了哪里，大明也一清二楚。
今年各市舶司统计，来自智利的硝石增加了两百万斤，而两百万斤硝石，只能换取十万斤的火硝，这些火硝足够秘鲁、智利总督府维持自身统治了。
在各国使者乘坐快船来到京师的时候，黎牙实邀请的天文学家、数学家迈克尔·马斯特林也如约来到了大明，在四夷馆见到了邀请他的黎牙实。
“二十年了，我们终于又见面了。”迈克尔看向了旁边的缇骑，在来的路上，那些到访过大明的使者，反反复复提醒过迈克尔，这些穿着飞鱼服的人，是大明最危险的人物。
“不必为我担忧，我现在有点麻烦，等和你见面之后，我要回去继续坐牢。”黎牙实的神态比较轻松，他已经更换了牢房，回到了自己的小单间里，这代表着自己顺利过关了。
“很危险吗？”迈克尔有些担心，大明似乎有些危险，他已经在考虑，是不是坐船回泰西了。
他来的很困难，这一路非常艰辛，为了黎牙实信中写的科学圣殿，迈克尔还是远渡重洋来到了大明。
“并不危险。”黎牙实想了想，还是和迈克尔分享了下自己的坐牢经历，这个经历有点漫长。
听完了黎牙实的描述，迈克尔愣愣的看着黎牙实，呆滞了很久，才惊讶的说道：“你这不是勇敢，是在向死神挑衅，大明皇帝难道是圣人吗？居然原谅了你这样无礼的冒犯！”
大明皇帝，东方世界至高无上的存在，而且因为没有神压在头上，大明皇帝的权力，就是神一样的存在。
黎牙实敢在泰西对神不敬吗？显然不敢。
但黎牙实在大明敢，还做了不止一次，还都顺利的活了下来。
“我又没有撒谎，我讲的每一句都是实话。”黎牙实嘴硬的回答了一句。
其实他也意识到了问题，见到了老朋友，在老朋友的提醒下，他才忽然意识到，自己确实有些幼稚了，这种行为非常不妥，像是在刀尖上起舞。
迈克尔更加疑惑，他摊开了两只手，十分不解的说道：“我的老朋友，你现在似乎变得幼稚了很多，讲实话就可以免除雷霆之怒吗？”
“你是勇敢的水手，你的足迹走过了无数的高山、河流和大洋，你知道，通常情况下，我们很难去讲实话。”
“就像现在，西班牙的每一位宫廷秘书，都知道应该劝说费利佩殿下停止远征英格兰，但没有一个宫廷秘书敢说出这句话来，甚至还要不断的附和，远征英格兰的必要。”
“让已经失控的暴君不那么愤怒，这样才能保住自己的性命。”
迈克尔途径西班牙，西班牙几乎每个人都知道远征英格兰已经成为了一个赔钱的买卖，最好的做法，就是停止远征。
如果一次就将英格兰拿下，那远征自然是大赚特赚，但这种旷日持久的拉锯远征，对帝国而言是非常致命的，西班牙从上到下都有了很多的怨言，但没人告诉做出决策的费利佩。
费利佩已经变成了一个失控的暴君。
“陛下还年轻。”黎牙实倒是很宽心，陛下一如既往的英明，虽然这些话，陛下听了不开心，但也不会过分威罚。
迈克尔低声说道：“费利佩年轻的时候，也是非常博学，且充满了智慧。”
黎牙实笑着说道：“等陛下老了，我早就死了，甚至连尸骨都腐朽到不能腐朽，我并不担心你说的问题。”
“好吧。”迈克尔闻言，也是露出了笑容，的确，他们俩个都已经快六十的人了，还能活几年呢？
“你在书信中，说已经知道了我的公式为什么会计算错误。”
“你告诉我，只要我来到大明就告诉我答案，现在，我就站在你的面前，你能告诉我原因吗？”迈克尔面色变得严肃了起来。
他赌上了自己的性命出海，就为了答案，他要知道自己追寻了一生的公式，究竟哪里出现了问题。
皇帝还准备以‘来都来了’为由留下迈克尔，这迈克尔根本就是抱着殉道的目的，才踏上来到大明的道路，来了也没打算走。
死在哪里都是死，但临死前搞不清楚自己错在哪里，死也不甘心。
“你看，你还说我是个疯子，其实你也是这样，我都没告诉你原因，你就来了。”黎牙实摇头，迈克尔看他是个疯子，迈克尔何尝不是？
从泰西到大明，这可是十万里水程，是滔天巨浪，是孤独，是疾病，但迈克尔义无反顾，收到书信，就踏上了寻道之路。
每个人都有每个人的执着。
“答案很简单，因为所有的轨道是椭圆的，而你多面体计算半径和周期的关系，自然是错的。”黎牙实指着身边的年轻人说道：“这位是伽利略，这位是徐光启，他们二人对你的公式进行了研究，你可以和他们沟通。”
“我还要赶回去坐牢，就不耽误你们交流了。”
黎牙实要履行自己鸿胪寺通事的职能，所以短暂出狱，等到迈克尔安顿下来，他就要继续翻译《天文学概要》了，里面有很多专业的名词，他需要迈克尔帮他翻译。
翻译才是他的主要工作，编笑话是副业，到大明时间长了，黎牙实也染上了士大夫针砭时事的通病。
“我听说过你伽利略，星空仰望者，你因为研究地球潮汐，被比萨大学给开除了，真的是很遗憾，在比萨大学，研究天文地理，是不被允许的。”迈克尔听说过伽利略，他的地球潮汐论，在泰西的学术界引起了很大的议论。
“我其实是因为说了些实话，得罪了佛罗伦萨柯斯摩公爵，才被比萨大学赶出去的，而不是地球潮汐论，我读的是医学，到大明之后，我依旧是一名医生，在解刳院做医倌，你可以叫我恶魔伽利略。”伽利略自我介绍了一下。
地球潮汐论并不是被开除的原因，佛罗伦萨公爵柯斯摩是个私生子，不学无术，他要修一个挖泥机械，疏通海港淤泥，伽利略就因为说设计这种机械挖不了淤泥，才被开除的。
解剖尸体是视为一种亵渎，被恶魔所蛊惑，所以按照泰西取外号的规则，他现在该叫恶魔伽利略。
“这位是徐光启，一名优秀的天文生，当然你可以叫他农夫徐光启，他现在在宝歧司做司农，对番薯育苗颇有研究，他学习天文学是为了研究更准确的历法和农时，让人们更好的耕种。”伽利略介绍了徐光启的身份。
农夫徐光启，他是农学院博士也是天文学博士，他在宝歧司负责舶来粮育种。
“很高兴认识你。”徐光启笑着说道：“迈克尔博士可能会比较好奇，行星的轨道真的是椭圆的吗？那么我们现在就出发，前往北大营的天文台吧。”
北大营天文台，直接隶属于皇家格物院，是大明最大的天文台，占地超过了四百亩，有天文博士二十三人，天文生五百人。
北大营天文台，下辖卧马岗天文台、兰州天文台、松江天文台、广州天文台、马尼拉天文台、椰海城天文台和在建的大金池天文台，按照规划，每一座天文台，要配套搭建五个观测点。
当小火车带着众人抵达北大营，乘坐马车来到北大营天文台的时候，迈克尔目瞪口呆的看着面前的天文台。
这是他见到占地面积最广、人数最多、仪器最完善的天文台，那一座座伸向天空的巨大望远镜，让他的手都颤抖了起来。
“我们要去的地方在北馆。”徐光启站在大门前，别说迈克尔，他每次过来也会惊讶，这样堪称宏伟的天文台，大明有整整七座。
“大明建造如此雄伟的建筑，观测天象，就只是为了校准农时吗？”迈克尔不敢置信的问道。
徐光启理所当然的点头说道：“当然是为了校准农时，我们的陛下也是一名农夫，除此之外，则是为了研究牵星过洋术，让大明船只不至于在广阔的大海上迷航。”
“这石头上刻的字是什么？”迈克尔指着门前巨大卧石上的字询问道。
徐光启面色凝重的说道：“这是陛下给我们这些格物博士的训示，意思是，人的一生要践行一个最基本的道理，那就是脚踏实地的信用和真实，绝不可虚妄，实践，是检验任何真理的唯一标准。”
这是格物院最重要的训示，也是研究万物无穷之理的最高准则，道理向实践让步。
迈克尔在徐光启、伽利略的带领下，走过了守备森严的大门，走过了开满了鲜花的回廊，踩着阳光透过树叶洒下的点点光斑，悦耳的鸟鸣在耳边回荡，一行人走到了北馆第一座观星台。
观星台高三丈，大明最大的一座反射望远镜，就坐落在这座观星台上。
明善望远镜，是大明最大的反射望远镜，取意明眸善睐，说的是它的眼眸非常明亮，它的主反射镜作用和人的眼睛一样，主反射镜越大，就看的越清楚，越平整，就越准确。
大明最大的一块反射镜片就只有一尺左右，这已经是工匠们的极限了，就这一块一尺大的反射镜，就用了一百多名工匠，整整六十四个月的时间去打磨。
格物院试图建造一个更大的反射镜片，希望可以看的更加清楚，但是很困难，一尺就像是个魔咒一样，无法打破。
口径为一尺，长达一丈的巨大望远镜，是嵌套在一个巨型六分仪和天球仪中，可以确定星天和行星轨道，这一口望远镜的造价为十二万银，等于五架五桅过洋船的造价，大约是五分之一个先帝皇陵。
这的确是人间奇迹。
“真的是神奇的地方，不愧是科学的圣殿，黎牙实没有骗我。”迈克尔的眼神充斥着迷离，他太喜欢那个望远镜了。
只要有了这个，他那套因为缺乏观测器械迟迟无法完善的理论，就能够越发的完善了。
“要怎么样才能使用这台神奇的望远镜呢？”迈克尔眼神炙热的看向了伽利略，就像是在看一个美人一样，眼里除了渴望没有其他。
“你要对大明做出卓越的贡献，我觉得你应该先从配合黎牙实翻译你的著作《天文学概要》开始，当然在大明的这段时间，藏书馆的一楼也对你开放，二楼是机密，三楼是最高机密，只有你成为格物博士，才能上到二楼。”伽利略详细的解释了下迈克尔这次学术交流的权限。
伽利略考取了大明的格物博士，成为了天文博士和医学博士，并且积极为大明做贡献，才能进入二楼，可是三楼他也上不去，只有被陛下特别准许，才能允许进入。
只是登上二楼，他仍然可以经过复杂的流程后回到泰西，只不过携带之物，不能有格物院成果，可以用脑子记，但不能用笔记录。
成为格物博士开始，就会享受缇骑的保护，这是保护也是监视，和任何人接触，都要被保护，防止刺杀和暗害的同时，也不能向外传递格物院的消息。
一旦登上三楼，就永远无法回到泰西了。
伽利略只想努力为大明做出贡献，如果能获得大明崇古进步奖和奇功牌，就可以上三楼了，接触大明最前沿的项目了，比如蒸汽机的改良、雷电研究、蒸汽轮机、滑翔机等等。
至于回泰西，伽利略没有想过，因为神已经抛弃他了，他回不去了，他现在搞的研究，就单单一个在解刳院任职，研究人体解刳，他就会被送上火刑柱。
“突然之间感觉要做的事情有点多，五年可能不太够用，伽利略，如果我想多停留一点时间，需要做什么吗？”迈克尔跃跃欲试。
伽利略一脸笑容的说道：“或许可以成为格物院的客座博士？我会帮你的，迈克尔博士。”
“这里是科学的圣殿，你可以专心的研究科学，没必要担心宗教、经费、器械的问题，其他都是条件成熟，自然而然就会发生。”
“不必顾虑。”
“那真的是太好了，什么时候可以开始翻译工作？”迈克尔已经迫不及待了起来。
伽利略和徐光启安顿好了迈克尔，示意他不要着急，休养好身体，到大医官做个体检后，再开始工作不迟，在不断的感谢声中，伽利略和徐光启离开了朝廷给迈克尔准备的住处。
“这种感觉非常奇妙，迈克尔走不了了，就像我留在大明一样，你注意到他的眼神了吗？他看那台望远镜，就像是野心家看到了传国玉玺一样热切。”伽利略回头看了眼，感慨万千，又骗到一位，颇有种吾道不孤的感觉。
“你这个比喻有些奇妙。”徐光启闻言，虽然怪异，但是贴切。
伽利略有些奇怪的问道：“很奇怪，陛下对科学的支持，有种狂信徒般的狂热，陛下多次拨款，都被德王殿下拒绝了，徐，陛下这种对科学的狂热支持，朝臣们就不阻拦吗？”
他见过那些保守派们保守起来，是如何疯狂，无所不用其极，只为破坏学者的科学研究，但大明皇帝的行为，朝臣们居然不加纠正。
“我们大明的皇帝，总是有些奇怪的爱好，陛下花的是自己的钱不务正业，朝臣们不好上谏，就一个铁马就把他们的嘴巴堵死了。”徐光启倒是觉得不奇怪，大明皇帝要是没点奇怪的癖好，那才是奇怪。
其实格物院花的真不多，绝对没有世宗皇帝焚修花的多。
伽利略倒是觉得格物院可能是皇帝和臣子斗争的一种手段，不过这和他没关系，他只要一心搞好科研就是了。
“陛下强留迈克尔的想法，失算了，现在就是赶他，都赶不走了。”伽利略笑着说道。
徐光启和伽利略完成了皇帝给的任务，留下更多的格物博士，让大明再次伟大。
天文学的快速发展，有利于大明的牵星过洋术的完善，商船不至于在广阔大海迷航，钻研万物无穷之理，有现实意义。
而在另外一边，朱翊钧收到了一个让他有些唏嘘的消息，十七年十二月，大明的老朋友、安东尼奥的大副、卡斯凯什侯爵、剑圣马尔库斯，死于了一场刺杀之中。
这次刺杀的目标是葡王安东尼奥，马尔库斯为保护安东尼奥而死。
这场刺杀是由西班牙国王费利佩指使刺客所为，发生在辛特拉王宫中国厅的转角楼梯处。
当时马尔库斯刚刚回到里斯本，和安东尼奥讨论了在中国的一些见闻，下楼的时候，三名刺客突然掏出了火铳，瞄准了安东尼奥。
马尔库斯眼疾手快，挡在了安东尼奥的身前，马尔库斯身中三枪后，仍挡在了安东尼奥身前，为逃跑争取了时间，在人生最后时刻，剑圣马尔库斯杀死了一名扑上来的刺客，又中了四剑，在血泊中，永远离开了人间。
安东尼奥毫发无伤。
而费利佩刺杀安东尼奥的理由非常简单，葡萄牙大量抛售金债券被费利佩发现，恼羞成怒之下，费利佩发动了刺杀。
这不是费利佩第一次采用刺杀的方式，解决棘手的敌人，比如尼德兰国父威廉·范·奥伦治，就死于费利佩派出的刺客热拉尔手中。
威廉死后，尼德兰北同盟通过了《誓绝法案》，和西班牙不死不休，哪怕费利佩重新武装占领，海外也有新尼德兰，继续抵抗西班牙的残忍统治。
“刺杀不能解决矛盾，费利佩二世已经错过一次了，他又错了第二次！”朱翊钧确信，费利佩现在的确是个失控的暴君了。